Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP3Q96P20 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms