Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC17Q96LX7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms