Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLMNQ96JQ2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLMNQ96JQ2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms