Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCANQ96GW7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms