Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EME1Q96AY2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EME1Q96AY2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms