Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRG4Q92954 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms