Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC148Q8NFR7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms