Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
P3H3Q8IVL6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
P3H3Q8IVL6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms