Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms