Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME9Q86XW9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME9Q86XW9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms