Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms