Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms