Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH2Q76I76 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH2Q76I76 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH2Q76I76 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH2Q76I76 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH2Q76I76 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH2Q76I76 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms