Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
OPN5Q6U736 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OPN5Q6U736 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms