Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4L9Q6RFH8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms