Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM29Q5VYK3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM29Q5VYK3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms