Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms