Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FRMPD3Q5JV73 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms