Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC39A12Q504Y0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms