Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA9Q16795 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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NDUFA9Q16795 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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NDUFA9Q16795 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA9Q16795 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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