Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms