Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF239Q16600 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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