Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3AQ14563 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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