Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCINQ13939 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCINQ13939 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CCINQ13939 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CCINQ13939 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CCINQ13939 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCINQ13939 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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