Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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IRF5Q13568 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF5Q13568 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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