Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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