Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2Q13563 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
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