Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RIGQ13278 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms