Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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