Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 TRIM27-207ENST00000498117 728 ntTSL 312.69□□□□□ -0.382e-7■■□□□ 14
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ILF3Q12906 TRIM27-206ENST00000496091 687 ntTSL 35.93□□□□□ -1.462e-7■■□□□ 14
ILF3Q12906 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.325e-8■■□□□ 14
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ILF3Q12906 LINC00470-202ENST00000577403 251 ntTSL 1 (best)2.66□□□□□ -1.985e-8■■□□□ 14
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ILF3Q12906 BSDC1-204ENST00000444377 2925 ntTSL 1 (best)10.34□□□□□ -0.751e-7■■□□□ 14
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ILF3Q12906 AKAP1-206ENST00000571629 3105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.666e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 AKAP1-219ENST00000621116 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.736e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 AKAP1-204ENST00000539273 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.836e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 AKAP1-203ENST00000481416 4089 ntTSL 59.4□□□□□ -0.96e-8■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.392e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.182e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.591e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.341e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.271e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 DEK-204ENST00000505224 1372 ntTSL 213.45□□□□□ -0.262e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 DEK-206ENST00000512145 791 ntTSL 56.45□□□□□ -1.382e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 DEK-208ENST00000515770 730 ntTSL 55.41□□□□□ -1.542e-6■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 UTRN-206ENST00000421035 572 ntTSL 26.24□□□□□ -1.413e-9■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 UTRN-213ENST00000628146 597 ntTSL 23.52□□□□□ -1.853e-9■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.436e-7■■□□□ 13.9
ILF3Q12906 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.298e-7■■□□□ 13.9
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