Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TROQ12816 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TROQ12816 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TROQ12816 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TROQ12816 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TROQ12816 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TROQ12816 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TROQ12816 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TROQ12816 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TROQ12816 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TROQ12816 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TROQ12816 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TROQ12816 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TROQ12816 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TROQ12816 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TROQ12816 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TROQ12816 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TROQ12816 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TROQ12816 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TROQ12816 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TROQ12816 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TROQ12816 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TROQ12816 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TROQ12816 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TROQ12816 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TROQ12816 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TROQ12816 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TROQ12816 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TROQ12816 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TROQ12816 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TROQ12816 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TROQ12816 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TROQ12816 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TROQ12816 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TROQ12816 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TROQ12816 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TROQ12816 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TROQ12816 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TROQ12816 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TROQ12816 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TROQ12816 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TROQ12816 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TROQ12816 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TROQ12816 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TROQ12816 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TROQ12816 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
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