Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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KCNMA1Q12791 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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KCNMA1Q12791 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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KCNMA1Q12791 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNMA1Q12791 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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KCNMA1Q12791 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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KCNMA1Q12791 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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KCNMA1Q12791 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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