Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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SREBF2Q12772 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SREBF2Q12772 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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