Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms