Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5Q00535 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5Q00535 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms