Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD1P98174 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD1P98174 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD1P98174 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD1P98174 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD1P98174 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD1P98174 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD1P98174 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD1P98174 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD1P98174 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FGD1P98174 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FGD1P98174 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FGD1P98174 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD1P98174 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD1P98174 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms