Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2P78314 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms