Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNRPD2P62316 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms