Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LMO4P61968 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMO4P61968 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMO4P61968 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms