Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2NP61088 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms