Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFRD-1P60508 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms