Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIK1P57059 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK1P57059 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIK1P57059 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIK1P57059 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIK1P57059 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIK1P57059 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK1P57059 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK1P57059 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK1P57059 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms