Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP9P55211 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP9P55211 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP9P55211 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP9P55211 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP9P55211 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP9P55211 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP9P55211 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms