Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK4P51957 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK4P51957 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK4P51957 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK4P51957 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK4P51957 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK4P51957 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK4P51957 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK4P51957 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms