Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RAB5CP51148 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RAB5CP51148 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RAB5CP51148 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RAB5CP51148 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RAB5CP51148 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RAB5CP51148 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RAB5CP51148 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB5CP51148 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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