Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP4P49662 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP4P49662 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP4P49662 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP4P49662 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms