Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK8P49336 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK8P49336 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK8P49336 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK8P49336 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK8P49336 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms