Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms