Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHKA1P46020 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms