Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LTBRP36941 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LTBRP36941 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LTBRP36941 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LTBRP36941 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms